2019-02-20: Genetyka: zsekwencjonowano genom żarłacza białego
Naukowcy z Nova Southeastern University, Cornell University College of Veterinary Medicine oraz Monterey Bay Aquarium zsekwncjonowali kompletny genom żałracza białego składający się z 4,63 miliarda par zasad, a więc półtora raza większy od genomu ludzkiego. DNA rekina porównywano następnie z genomem innych kręgowców, m.in rekina wielorybiego i człowieka. Dzięki badaniu potwierdzono, że długowieczność tego gatunku zależna jest od stabilności genomu i wielu genów służących do naprawiania DNA.
Około 60% genomu żarłacza błękitnego stanowiły powtarzające się fragmenty DNA, z czego znaczna część to retrotranspozony typu LINEs (Long interspersed nuclear element) tworzące przerwy w niciach DNA wymagające naprawy. Duża częstotliwość takich przerw może powodować większą niestabilność genomu i przyczyniać się do nowotworzenia, jednak presja selekcyjna badanych rekinów doprowadziła do tego, że ich odporność na raka jest znacznie większa. U żarłacza białego występuje wiele genów służących do naprawiania DNA i uaktywniających odpowiedź na uszkodzenia, co stabilizuje genom. Ponieważ ryby te są znane także z dużej czułości zapachowej, spodziewano się też odkrycia licznych genów receptorów węchowych. W genomie było ich jednak niewiele, za to odkryto inną grupę kilkunastu genów (vomeronasal genes), które mogłyby odpowiadać za rozpoznawanie zapachu.
Żarłacze białe przedstawiane są w dziełach kultury masowej jako bardzo groźne dla człowieka zwierzęta. Jak stwierdził jeden z autorów badań, Michael Stanhope, w rzeczywistości to ludzie zabijają je znacznie częściej z powodu przekonań dotyczących skuteczności medycyny alternatywnej. Zakłada przy tym, że lepsze poznanie biologii tych kręgowców może zmienić ich obraz w świadomości ludzi.
Źródła
edytuj- Great white shark genome decoded – sciencedaily.com, 18 lutego 2019
- Huge Genome Reveals Sequence Adaptations in Key Wound Healing and Genome Stability Genes Tied to Cancer Protection – Nova Southeastern University
- Kimberly Hickok – Here's Why Great White Sharks Are Natural-Born Superheroes – livescience.com, 19 lutego 2019
- Ashley Yeager – Certain adaptations identified in the fish’s DNA linked to wound healing, cancer protection, and a long life – the-scientist.com, 19 lutego 2019
- Nicholas J. Marra, Michael J. Stanhope, Nathaniel K. Jue, Minghui Wang, Qi Sun, Paulina Pavinski Bitar, Vincent P. Richards, Aleksey Komissarov, Mike Rayko, Sergey Kliver, Bryce J. Stanhope, Chuck Winkler, Stephen J. O’Brien, Agostinho Antunes, Salvador Jorgensen, and Mahmood S. Shivji – White shark genome reveals ancient elasmobranch adaptations associated with wound healing and the maintenance of genome stability – PNAS doi.org/10.1073/pnas.1819778116, 19 lutego 2019